Por estos años el ITESO comenzó a tener mayor presencia e incidencia en la sociedad, tanto tapatía como a nivel nacional. Un hecho importante fue la adquisición del inmueble donde ahora se ubica la Casa ITESO-Clavigero, cuyo trabajo ha permitido el crecimiento de la divulgación científica y la cultura en la ciudad.

1997

El 21 de marzo se firmó el convenio entre la Universidad de San Francisco y el sistema conformado por la Universidad Iberoamericana (UIA) y el ITESO. El 24 de junio se inauguró la planta de tratamiento de aguas residuales del ITESO.

1998

El 3 de abril se nombró Rector al licenciado David Fernández Dávalos, SJ (foto).

1999

En noviembre, el ITESO adquirió la casa González Luna, hoy Casa ITESO-Clavigero, ubicada en la calle José Guadalupe Zuno 2083, entre la Av. Chapultepec y Marsella.

2000

En febrero, el ITESO fue sede de la XVII Reunión de Planeación Anual del Sistema Educativo UIA-ITESO.

2001

El 25 de abril se inauguró la Casa ITESO-Clavigero (foto).

El 28 de agosto iniciaron las clases en la preparatoria itesiana de Atotonilco, Jalisco.

2002

El 7 de enero inició el rectorado del ingeniero Héctor Acuña Nogueira, SJ (foto).

2003

El 1 de agosto, la biblioteca de Ignacio González Luna Morfín fue donada a la Biblioteca del ITESO.

2004

El 21 de enero, el ITESO recibió oficialmente el Registro de Excelencia Académica que otorga la SEP. El 9 de diciembre se firmó el convenio para adquirir el archivo profesional del arquitecto Ignacio Díaz Morales. Carlos Plascencia Möller (foto) comenzó su periodo como presidente de ITESO, A.C.

2006

El 3 de mayo, la Secretaría de Educación Pública, a través del Instituto Nacional de Bellas Artes, declaró Monumento Artístico Nacional a la Casa ITESO-Clavigero.